人類疾病網絡分析報告(ppt 73頁)
人類疾病網絡分析報告(ppt 73頁)內容簡介
人類疾病網絡分析報告內容提要:
HDN的性質:
如果一個人類疾病有不同並且唯一的遺傳原因,那麼HDN對應的是不連通的孤立點。但,獲得的HDN包含了單個疾病間和疾病類間的很多關聯。1284個疾病中,867個至少一個邊關聯到其他疾病,516個疾病形成一個巨大的類,暗示很多疾病同其他疾病是同享遺傳原因。
一個疾病關聯的基因數目s有很寬的分布,暗示大多數疾病關聯到少數基因,很少的疾病關聯到很多基因。白血病s=37,結腸癌s=34等。HDN的度分布也是冪律的,結腸癌k=50
HDN有明顯的聚類現象,但在不同疾病類之間有明顯的不同。癌症類因為共享很多癌基因,所以緊密相連,並且還有很多疾病同癌症有強相關;代謝疾病沒有明顯的形成一個不同的類。如圖三
為了量化這種差異,我們衡量了每個疾病類的基因座異質性和連通性(HDN中彼此連接的一部分疾病)。如圖四,紅色代表較高的顯著性,藍色代表較低的顯著性。發現癌症有著較高的異質性和連通性,而代謝類有較低的異質性和連通性。
基因座異質性:指多於一個基因的變異。用屬於這個類的疾病中基因的平均數目(也就是節點的平均大小)來衡量。一個類的連通性:用在HDN中彼此互相關聯的一部分疾病來衡量
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HDN的性質:
如果一個人類疾病有不同並且唯一的遺傳原因,那麼HDN對應的是不連通的孤立點。但,獲得的HDN包含了單個疾病間和疾病類間的很多關聯。1284個疾病中,867個至少一個邊關聯到其他疾病,516個疾病形成一個巨大的類,暗示很多疾病同其他疾病是同享遺傳原因。
一個疾病關聯的基因數目s有很寬的分布,暗示大多數疾病關聯到少數基因,很少的疾病關聯到很多基因。白血病s=37,結腸癌s=34等。HDN的度分布也是冪律的,結腸癌k=50
HDN有明顯的聚類現象,但在不同疾病類之間有明顯的不同。癌症類因為共享很多癌基因,所以緊密相連,並且還有很多疾病同癌症有強相關;代謝疾病沒有明顯的形成一個不同的類。如圖三
為了量化這種差異,我們衡量了每個疾病類的基因座異質性和連通性(HDN中彼此連接的一部分疾病)。如圖四,紅色代表較高的顯著性,藍色代表較低的顯著性。發現癌症有著較高的異質性和連通性,而代謝類有較低的異質性和連通性。
基因座異質性:指多於一個基因的變異。用屬於這個類的疾病中基因的平均數目(也就是節點的平均大小)來衡量。一個類的連通性:用在HDN中彼此互相關聯的一部分疾病來衡量
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