國家基金申請成功範本(pdf 22)

電子信息雜交策略是依據比較基因組定位結果，充分利用豬EST（expressed sequence tag, EST）數據庫的信息資源，借助計算機輔助進行基因的克隆，又稱為“silicon cloning”。其基本原理是利用研究深入、標記稠密的哺乳動物基因組保守功能基因的編碼區序列（CDS）作為信息探針，在豬EST數據庫篩選同源EST(s)(標準：長度≥100bp，同源性75%～95%) ，排除已克隆EST(s)後進行拚接，設計引物獲取基因(cDNA) 全長（Altschul 等，1990；Mao等，1998；A田芳等，2000；Cirera 等，2000）。該方法的特點是：（1）是建立在生物信息學分析的基礎上，進行同源性比較和計算機輔助克隆新基因，具有快速、簡便、直接等優點；(2) 因為該方法在選擇候選基因時有很強的目的性，是一種與定位克隆、定位候選克隆策略並列的比較候選基因法；（3）由於該方法是利用的是EST即cDNA部分序列信息，因而能夠獲得基因(cDNA) 全長（Liang等，2000）。
利用電子信息雜交策略在分離豬基因中的應用才剛起步（Cirera 等，2000），但該方法在人及其它動物基因分離中已經有廣泛的應用（Mao等，1998；Bolognese, 等，2000；畢安定等，2000；範玉新等，1999），由此可見，利用電子信息雜交策略分離豬基因將具有良好的應用前景，在國內開展十分必要。

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